Η Διεύθυνση Φυσικής Αγωγής σε συνεργασία με τη Διεύθυνση Ειδικής Αγωγής και Εκπαίδευσης του ΥΠ.Π.Ε.Θ. στο πλαίσιο της εκπαιδευτικής πολιτικής και του δικαιώματος συμμετοχής στις σχολικές δραστηριότητες όλων των μαθητών/τριων, υλοποίησε αθλητικά προγράμματα συνεκπαίδευσης και συνέργειας μεταξύ σχολικών μονάδων ειδικής και τυπικής αγωγής.
Θεωρώντας σημαντική την ένταξη των μαθητών/τριων ΣΜΕΑΕ στη διεξαγωγή σχολικών αθλητικών δραστηριοτήτων στην Πρωτοβάθμια και Δευτεροβάθμια Εκπαίδευση της χώρας, για το σχολικό έτος 2016-2017 υλοποιήθηκαν αθλητικές δράσεις (καλαθοσφαίριση, ποδόσφαιρο, πετοσφαίριση, χειροσφαίριση, στίβος, beach volley κ.ά), οι οποίες πραγματοποιήθηκαν σε σχολικές μονάδες της χώρας και στα Γυμναστήρια εποπτείας του ΥΠ.Π.Ε.Θ. Ε.Γ.Α. «ο Ι. ΦΩΚΙΑΝΟΣ» και Δ.Π.Π.Γ. Καισαριανής, με τη συμμετοχή 1490 μαθητών/τριων ΣΜΕΑΕ.
Η Διεύθυνση Φυσικής Αγωγής του ΥΠ.Π.Ε.Θ. με στόχο την ισότιμη αντιμετώπιση των παιδιών με αναπηρία, στον προγραμματισμό της νέας σχολικής 2017-2018 στοχεύει στην αύξηση των εν λόγω αθλητικών δράσεων ως έμπρακτη απόδειξη του σεβασμού και της αποδοχής στη διαφορετικότητα.
